從土壤向大氣排出CO2的一種現象。土壤中高等植物根、細菌、真菌和土中動物呼吸時排出的CO2經擴散等途徑返回大氣，構成為碳素循環的一個支路。就根系發育良好的植物群落來說，根的呼吸雖約占土壤呼吸的30％，但一般的所占比例卻小得多，而好氧微生物的呼吸是主要的。土壤中的大量有機質、無機養料的施用和適宜的土壤氣候（土壤中水、氣、熱等環境條件）都可促進真菌和好氧細菌的活動，增強土壤呼吸。單位面積和時間內的土壤呼吸量，即土壤呼吸強度（CO2／米2／小時），在熱帶雨林下為0.4—1.0，暖溫帶照葉林下為0.2—0.6，溫帶落葉林下為0.15—0.4。土壤微生物的呼吸部分與可溶性有機炭量有密切關系。
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