遺傳學的一個分支學科。主要研究基因如何控制生物胚胎發育的問題。從遺傳的觀點看，生物的發育就是由基因型逐漸轉變為表現型的過程。基因控制發育的特點是有時序性和空間性。從受精卵開始，經過細胞決定、胚層分化到組織、器官的形成，每一步基因的表達都是嚴格有序的，并且體現出一定的空間結構。在這過程中，如果基因發生突變，就會造成相應階段發育的異常、停頓，甚至胚胎的死亡。發生遺傳學的研究方法，主要是利用影響發育的突變型與正常的發育型進行比較，并結合實驗胚胎學、細胞生物學和分子生物學的方法技術，從不同水平分析基因和性狀發育的關系，以闡明基因控制發育的機理。常用的實驗材料是黑腹果蠅和小鼠。60年代英國科學家布倫納（S.Brenner）提倡用雅致隱桿線蟲（Caenorhabditiselegans）來研究發生遺傳學和行為遺傳學問題，已取得某些進展。