遠緣雜交(distant hybridization)一般是指在分類學上物種(species)以上分類單位的個體之間交配。遠緣雜種同近緣雜種相比，除了具有綜合父、母雙親的遺傳特性，能產生重組類型以及后代出現性狀分離等作為雜種的基本特征外，還有一些特有的征狀，如下：

①高度不育性。主要是由于染色體的不親和與生理平衡受到嚴重干擾等引起的。

②雜種后代會出現“瘋狂分離”現象。所謂“瘋狂”是指后代性狀分離的類型很多，穩定性差，有時甚至到十多代后還出現分離。

③雜種后代比較容易回復到親本類型，這是因為遠緣雜種的中間類型的生活力和育性都比較差，在選擇壓力下很容易被淘汰。

④有些遠緣雜種在胚胎發育過程中，會發生一個親本排斥另一親本染色體的現象。

⑤遠緣雜種的生活力一般低下，在很多情況下在胚胎期就死亡。

⑥遠緣雜種不育是很普遍的現象。例如母馬和公驢雜交生下的騾子不能生駒。但在植物中可用秋水仙素等化學藥物處理雜種的生長點或分蘗節等有分生組織的部位，使體細胞的染色體加倍，變成異源四倍體，每一條染色體都有雙份，就能像二倍體一樣進行正常的減數分裂，形成可育的配子，這樣，遠緣雜種就可以有正常的繁殖能力。