用分子量子力學方法研究藥理學問題的一門新興邊緣科學。量子藥理學以分子量作為基本功能單位，在分子量子水平上說明具有生物活性的化合物的藥理作用，目的在于進一步闡明并解釋化學結構與生物活性之間的關系。根據分析，作為藥物的化學物質與生物系統是由分子量子構成，分子量子系由原子構成，而原子量終由基本粒子構成。把量子力學應用到藥理學問題上似乎有許多優點。量子力學之所以特別合適，是因為它能從相當直接的方式告訴我們分子內的電子密度。當一個小分子接近一個受體分子的活性部位時，這兩個物種的電荷密度將發生變化而相互作用。藥理學家希望知道“一種活性分子在它起主要作用的一瞬間所呈現的精確的三維電子密度到底為何種形式”，分子量子力學可能是提供這一答案的最好手段。