外源性感染是指由來自宿主體外的病原菌所引起的感染。傳染源主要包括傳染病患者、恢復期病人、健康帶菌者，以及病畜、帶菌動物、媒介昆蟲等。

內源性感染有少數細菌在正常情況下，寄生于人體內，不引起疾病。當機體免疫力減低時，或者由于外界因素的影響，如長期大量使用抗生素引起體內正常菌群失調，由此而造成的感染稱之為內源性感染。