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蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類數(shù)據(jù)庫

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-09-19

    蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類(SCOP)數(shù)據(jù)庫詳細(xì)描述了已知的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)之間的關(guān)系。分類基于若干層次:家族,描述相近的進(jìn)化關(guān)系;超家族,描述遠(yuǎn)源的進(jìn)化關(guān)系;折疊子(fold),描述空間幾何結(jié)構(gòu)的關(guān)系;折疊類,所有折疊子被歸于全α、全β、α/β、α+β和多結(jié)構(gòu)域等幾個(gè)大類。SCOP還提供一個(gè)非冗余的ASTRAIL序列庫,這個(gè)庫通常被用來評估各種序列比對算法。此外,SCOP還提供一個(gè)PDB-ISL中介序列庫,通過與這個(gè)庫中序列的兩兩比對,可以找到與未知結(jié)構(gòu)序列遠(yuǎn)緣的已知結(jié)構(gòu)序列。

 
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