1 HAP吸附雜交：羥基磷灰石（HAP）層析或吸附是液相雜交中最早使用的方法。在液相中雜交后，DNA：DNA雜交雙鏈在低鹽條件可特異地吸附到HAP上。通過離心使吸附有核酸雙鏈的HAP沉淀，再用緩沖液離心漂洗幾次HAP，然后將HAP置于計數器上進行放射性計數。
　　2 親合吸附雜交：生物素標記DNA探針與溶液中過量的靶RNA雜交，雜交物吸附到酰化親合素包被的固相支持物（如小球）上，用特異性抗DNA：RNA雜交物的酶標單克隆抗體與固相支持物上的雜交物反應，加入酶顯色底物，這個系統可快速（2h）檢測RNA。
　　3 磁珠吸附雜交：Gen – probe公司最近應用吖啶翁酯（acridinium ester）標記DNA探針，這種試劑可用更敏感的化學發光來檢測。探針和靶雜交后，雜交物可特異地吸附在磁化的有孔小珠（陽離子磁化微球體上）。溶液中的磁性小珠可用磁鐵吸出，經過簡單的漂洗步驟，吸附探針的小珠可用化學發光測定。