根據土壤特性施用堿性土壤，可以施酸性或生理酸性的氮肥，如硫酸銨、氯化銨等，它們除了能中和土壤中的堿性外，還能形成容易被作物吸收的銨態氮；而在酸性土壤上，可選施堿性或生理堿性氮肥，如尿素、硝酸鈉、硝酸鈣、硝酸銨鈣或石灰氮等。它們一方面可降低土壤中的酸性，另一方面在酸性條件下形成容易被作物吸收的硝態氮。在鹽堿土中不宜施用含氯的氯化銨，以免增加鹽分，影響作物生長。肥沃的土壤施氮量要少，保肥能力強的土壤施肥次數可少些；反之，施氮量應適當增加，而且要分次施用。

根據作物種類與生長情況施用各種作物對氮的需求是不一樣的，如甘蔗、葉菜類蔬菜等作物需氮較多，水稻、玉米、小麥等作物需氮中等，而豆科作物有根瘤菌固定空氣中的氮素，因而需氮較少。不同作物對氮肥品種的反應也不同，如水稻施用銨態氮肥，尤以氯化銨、碳銨和尿素效果好。馬鈴薯施用硫酸銨效果好。忌氯作物如煙草、淀粉類作物、葡萄等應少施或不施氯化銨。多數蔬菜施用硝態氮肥效果好。作物不同生育期施氮肥的效果也不一樣。在作物需肥的關鍵時期，如在營養臨界期或最大效率期進行施肥，增產作用顯著。如玉米在抽穗開花前后需要養分最多，重施穗肥能獲得顯著增產。所以根據作物對養分的要求，掌握適宜的施肥時期和數量，是有效施用氮肥的關鍵。

根據氮肥的性質施用碳銨、氨水都要深施蓋土，防止揮發。由于它們都是速效肥，在土壤中又不易流失，故可作基肥和追肥，適宜在水田、旱地施用；硝態氮肥在土壤中移動性大，肥效快，適宜作旱地追肥。尿素中的氮素呈氨基態存在，在土壤中一般需經轉化，作物才能大量吸收，轉化前其肥效沒有銨態氮肥和硝態氮肥快，作追肥應比一般肥料提前3～5天，不宜作種肥，但尿素作為根外追肥最為理想，適用于各類土壤和各種作物。總之，要根據氮肥的特性來考慮其施用方法。

與適量磷鉀肥配合施用在缺乏有效磷和有效鉀的土壤上，單施氮肥效果很差，增施氮肥還有可能減產。因為在缺磷、鉀的情況下，蛋白質和許多重要含氮化合物都很難形成，嚴重影響作物生長。各地試驗已證明，氮肥與適量磷鉀肥配合施用，增產效果顯著。