1、 采用合理的耕作方式。在坡度較大的地區，易發生化肥徑流流失，應采取保護耕作（免耕或少耕）以減少對土壤的擾動，還可利用秸稈還田減少徑流流失。在以滲漏為化肥主要流失方式的平原地區，可采取耕作破壞土壤大孔隙，或控制排水保持土壤濕度，避免土粒干燥產生大孔隙引起滲漏。

2 、采用合理的灌溉方式。對旱作提倡采用滴灌、噴灌等先進灌溉方式，盡量減少大水漫灌；對水田要加強田間水管理，盡量減少農田水的排放。

3、 采用適宜的輪作制度。適宜的輪作制度可提高化肥的利用率，減少流失。如豆科作物與其他作物輪作，可節省化肥用量；深根作物與淺根作物輪作可充分利用土壤中的養分。

4、 有條件的地區可利用田間渠道、靠近農田的水塘和溝渠等暫時接納富營養的農田排水，灌溉時再使用，實現循環利用。

5、 在農田和受保護的水體之間，應利用自然生態系統建立緩沖帶，或在河濱、湖濱人工設置保護帶以攔截過濾從農田流出的養分，提高營養物質的凈化能力，防止養分流入周圍河流、湖泊和水庫等水體。