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蔬菜在播種前須對苗床營養土進行消毒，確保在生長發育過程中健壯成長。
福爾馬林消毒法：每1000公斤營養土用40％的福爾馬林250克，對水60公斤噴灑攪拌均勻后堆放，用塑料薄膜覆蓋24小時，揭開薄膜10～15天即可播種。此法適用于小粒蔬菜種子的播種。
多菌靈消毒法：每平方米苗床用50％的多菌靈8～10克與適量細土混勻。取其中的三分之二撒于床面做墊土，另外三分之一于播種后混入覆土中。此法能夠迅速殺滅土壤中的病微生物，促進蔬菜種子發芽，提高整齊度。
敵克松消毒法：用70％的敵克松藥粉0.5公斤拌細土20公斤，混勻后撒在營養土表面，播種后按種子直徑的大小覆土。此法防止蔬菜菌期猝倒病、立枯病效果顯著。
瑞毒霉消毒法：用25％的瑞毒霉50克對水50公斤，混勻后噴灑營養土1000公斤，邊噴灑邊攪拌均勻，堆積1小時后攤在苗床上即可播種。此法適用于防治蔬菜炭疽病、立枯病、猝倒病。
硫酸亞鐵消毒法：蔬菜播種前5～7天，在培養土上澆灑2％～3％的水溶液，每平方米用藥4.5千克，攪拌均勻。此法適用于喜歡酸性土壤蔬菜的播種。
波爾多液消毒法：每平方米營養土用等量式（硫酸銅：石灰：水的比例為1：1：100）波爾多液2.5公斤，加賽力散10克噴灑土壤，待土壤稍干即可播種扦插。對防治蔬菜黑斑病、銹病、褐斑病、炭疽病效果明顯。
代森銨消毒法：代森銨殺菌力強，能滲入植物體內，在植物體內分解后還有一定肥效。用50％代森銨350倍水溶液，每平方米苗圃土壤澆灌3公斤稀釋液，可防治蔬菜的黑斑病、霜霉病、白粉病、立枯病等多種病害。
五氯硝基苯消毒法：每平方米苗圃地75％五氯硝基苯4克、代森銨5克，混合后再與12公斤細土拌勻。播種時下墊上蓋，防治蔬菜炭疽病、立枯病、猝倒病等有特效。
