中性學說（或者更確切地說是中性突變-隨機漂變假說）是分子生物學與群體遺傳學交融的產物。它不象傳統的綜合理論（或新達爾文派的觀點），它明確主張：進化中大多數突變型的置換，不是由于正達爾文選擇，而是由選擇上呈中性或近中性的突變型的隨機固定所致。它還斷言，分子水平上大多數種內遺傳多態性，象以蛋白質多態性形式展現出來的那樣，是選擇上呈中性或近中性的，并靠著突變輸入和等位基因的隨機清除或固定這兩者之間的平衡而在物種中維持。應該說，這一理論對于人們所認識的分子進化眾多現象與規律的闡釋比新達爾文更為科學，且提出的多項預測被隨后的實驗研究所證實。問題是，它作為一種更基本層次－分子水平的進化理論未能給更高層次的進化提供理性闡釋與描寫。中性論者過多地注目于與功能無關的分子進化，而忽視了與功能相關的分子進化現象與規律的探索，這恐怕是中性理論之所以能問世，但同時又先天性地帶上無視宏觀進化，對宏觀進化束手無策這一天然缺陷的癥結所在。