實驗動物按遺傳學可分為相同基因類型和不同基因類型兩大類。相同基因類型又分為近交系、突變系和雜交F1代；不同基因類型又稱遠交群或封閉群。
一、實驗動物品種、品系的概念
1. 種 種(species)是生物學分類的最基本單位。在實驗動物學中，種是指有繁殖后代能力的同一種類的動物。而有生殖隔離的動物則是異種動物。
2. 品種 種以下還可有進一步小的分類，如品種(stock)。品種一般系指具有一些容易識別和人們所需要的性狀，而且可以基本穩定的遺傳的動物群體。如新西蘭白兔、青紫蘭兔、Wistar大鼠、KM小鼠等。
3. 品系 在實驗動物學中把基因高度純合的動物稱作品系(strain)動物。 例如，C57BL/6是近交系動物中的一個品系，屬低癌組、高補體活性的動物。 又如，肌萎縮癥(dystrophia muscularis)小鼠是帶有突變基因(dy/dy)的品系動物。
4. 雜交系 兩個近交品系動物之間有計劃交配，獲得的第一代動物， 稱之為雜交系(hybrid strain)或雜交一代動物，簡稱F1動物。
二、作為品系、品種的條件
作為一個品系或品種，應具備以下條件：
(一)相似的外貌特征：例如小鼠C57BL/6品系的毛色是黑色的,DBA/2 品系的毛色是灰色的,KM品種的毛色是白色的。當然,相似的外貌特征只是品系、品種應具備的條件之一。不同品系、品種的動物也有外貌相似的,例如A、KM等十幾個，品種、品系動物的毛色都是白色，但它們在其他的條件上是有區別的。
(二)獨特的生物學特性：獨特的生物學特性是一個品系、品種存在的基礎。在長期的研究過程中，科學工作者在一些動物身上發現了所需要的不同于其他動物的生物學特性，進行定向選擇，將這些特性保留下來，成為今天為數眾多的品系、品種。就白化小鼠而言多達幾十種，但每個品系、品種的生物學特性都有或多或少的差別。例如A品系,在經產鼠中高發乳腺腫瘤，對致癌物質敏感，易產生肺癌，老年鼠多有腎臟病變； AKR品系自發淋巴細胞白血病；ICR品種繁殖能力強。
(三)穩定的遺傳性能：作為一個品系，不僅要有相似的外貌特征，獨特的生物學特性，更重要的是要有穩定的遺傳性能，即在品系、品種自群繁殖時，能將其特性穩定地傳給后代。換言之，就是一個品系、品種必須具有一定的育種價值。
(四)具有共同遺傳來源和一定的遺傳結構：任何品系品種都可追溯到其共同的祖先,并由此分支經選育而成，其遺傳結構也應是獨特的。例如KM小鼠Glo-1位點為a基因單一型，而NIH小鼠在該基因呈多態分布，a、b型基因頻率分別為67%和33%。如果將上述兩個品種建立基因概貌就發現它們在基因概貌上的差異，而品種內這種差異是有限的。