棉花枯萎病苗期即可發病。發病后癥狀表現多種，有青枯型、黃化型、黃色網紋型、皺縮型、紅葉型等；青枯型：棉株遭受病菌侵染后突然失水，葉片變軟下垂萎蔫，接著棉株青枯死亡。黃化型：多從葉片邊緣發病，局部或整葉變黃，最后葉片枯死或脫落，葉柄和莖部的導管部分變褐。黃色網紋型：子葉或真葉葉脈褪綠變黃，葉肉仍保持綠色，病部出現網狀斑紋，漸擴展成斑塊，最后整葉萎蔫或脫落。該型是本病早期常見典型癥狀之一。皺縮型：表現為葉片皺縮、增厚，葉色深綠，節間縮短，植株矮化，有時與其它癥狀同時出現。紅葉型：苗期遇低溫，病葉局部或全部現出紫紅色病斑，病部葉脈也呈紅褐色，葉片隨著枯萎脫落，棉株死亡。半邊黃化型：棉株感病后葉半邊表現病態黃化枯萎，另半邊生長正常。該病有時與黃萎病混合發生，癥狀更為復雜，表現為矮生枯萎或凋萎等。縱剖病莖可見木質部有深褐色條紋。濕度大時病部出現粉紅色霉狀物。

防治方法：發病田塊可畝用棉枯凈30克對水45公斤，或12.5%速效治萎靈等藥劑加磷酸二氫鉀、綠風95等葉面肥，采用噴霧與灌根相結合的方法，每株用藥液50-100毫升，隔5天用藥一次，連續用藥2-3次。未發病地塊，應噴灑黃腐酸有機肥或綠風95、磷酸二氫鉀等葉面肥，以提高棉株抗病力，減少發病。防治過程中注意每7天1次，連噴2-3次。