根腐病　大豆整個生育期均可發病。病初莖基部出現黑褐色病斑，并向上擴散至下部側枝，病莖髓部變褐色，葉柄基部縊縮，葉片下垂。藥劑防治可用種子重量0.3%～0.4%的58%瑞毒霉·錳鋅或72%克露拌種。

　　

　　菌核病　7月下旬開始發病。病初莖稈上出現褐色病斑，以后病斑上著生白色絮狀物和白色顆粒，最后白色顆粒變成黑色。縱剖病莖可見黑色菌核。藥劑防治可用50%速克靈1000倍液，或40%菌核凈1000倍液，或50%甲基托布津500倍液噴霧。

　　

　　灰斑病　6月上中旬開始發病，7月中旬進入發病盛期。7～8月份遇高溫多雨天氣發病重。主要危害葉片，嚴重時葉片上布滿病斑，葉片過早脫落，造成嚴重減產。藥劑防治除在播前用種子重量0.3%的70%敵克松或50%福美雙拌種外，還應在大豆花莢期每畝用40%多菌靈100克加水30公斤噴霧。