磷對洋蔥幼苗期的發育十分重要,可以直接影響株高和葉數的增加，甚至根系也會因缺磷而發育不良。在鱗莖肥大期缺磷，也會減產。如果磷素吸收過剩，則鱗莖外部的鱗片會發生缺鈣；內部鱗片會發生缺鉀；鱗莖盤(底盤)會表現缺鎂，于是肌腐、心腐和根腐等生理病害則由之發生。
　　必須指出的是，一旦出現缺磷的癥狀后再向土壤追施磷肥已無濟于事。因此，必須事先在基肥中配加磷肥；或用磷酸二氫鉀液噴灑葉面補肥，作為應急措施。 　鈣吸收不足，則根部和生長點的發育機能會受到影響，組織內的碳水化合物也會降低；從而影響鱗莖的生長和品質，這也是導致發生心腐和肌腐病的直接原因。若鈣吸收過量，會導致微量元素的失調。