白腐病　白腐病又稱褐腐病、疣孢霉病，是棚菇病害中發生最普遍、危害最嚴重的一種真菌病害。防治時需要做到：

    １、培養料在菇房內二次發酵時，用通蒸汽法進行處理。具體做法是：用巴氏消毒法滅菌處理，溫度保持在６０℃左右，并持續６—１０小時。

    ２、覆土時用福爾馬林（２公斤／立方米）消毒，并在覆土后調節水量時用高效殺菌劑（５００—１０００倍）或多菌靈（５００—１０００倍）均勻噴灑菇床面和周圍環境。

    ３、一旦發生病害，必須做到：第一，立即停止澆水，加大通風量，降低菇房溫度和濕度；第二，立即挖掉病菇、菌絲塊和周圍的覆土，并且撒上石灰集中銷毀，防止再次感染；第三，換上新土后，在原發病部位均勻噴灑福爾馬林、高效殺菌劑或多菌靈。使用濃度同上或加倍。嚴重時菇房內用福爾馬林（１０毫升／立方米）或氣霧消毒盒（２—４克／立方米）熏蒸１小時，通風２—３天，待床面干燥后再噴藥。

    鬼傘菌　鬼傘菌又名野蘑菇。這種菌主要產生于溫度過高的培養料中。因而在堆制培養料時，首先選擇無霉變的原料，同時調整好碳氮比，避免含氮量過高，當游離氮含量過高時，要用甲醛進行處理；其次在發菌階段切記不要使料溫過高，避免病菌的產生。如果菌床上已經出現鬼傘菌，應立即拔除干凈，隨后通風降溫，待室溫下降后，病菌便自行消失。

    菇蠅、蚊　菇蠅、蚊主要來自培養料中，另外周圍環境的糞肥也是其棲息之地，只要注意環境衛生和培養料的發酵消毒環節就可防治其發生。可用菊樂合酯１０００倍液或敵殺死１０００倍液噴灑處理防治其危害。

    線蟲　線蟲主要棲息于土壤中，隨覆土進入菇房。將培養料經巴氏消毒處理后能有效殺滅線蟲。在線蟲發生輕度時可用殺蟲雙乳劑５０倍液或馬拉松乳劑５００倍液噴灑菇房內的料面，嚴重時用磷化鋁熏蒸菇房效果較好。

    螨蟲　螨蟲主要潛伏在糞肥中，可隨培養料侵入菇房，將培養料進行巴氏消毒處理后能有效地控制其發生。另外，在堆料時拌入三氯殺螨醇或在床面上噴灑菊樂合酯１０００倍液和敵敵畏１０００倍液。嚴重時用磷化鋁熏蒸處理也可。