香菇出菇期管理的重點是割膜和疏蕾。

菇蕾剛出現時及時割膜，用刀片環繞菇蕾將塑料薄膜切割成“活動門扇”。這樣可以讓菇蕾從中順利鉆出，又可以防止大的氣流進入，避免培養料水分過多流失。注意不能在菇蕾觸及或頂到塑料薄膜時再割膜，否則會產生畸形菇。菇蕾鉆出后，發現叢生菇蕾（2～3個或更多的菇蕾擠在一起）應疏蕾，用刀尖將邊緣的菇蕾切去。如果操作不方便，可以只將其他菇蕾的菌蓋削去，只保留1個形態良好的菇蕾。

蹲蕾的目的是培育個大、肉厚的菇蕾。蹲蕾的手段是降溫。幼菇蕾在15～22℃的溫度下生長速度快，溫度在14℃左右時生長減緩。將溫度降至12℃，甚至8℃，可以達到蹲蕾的目的。配合短時間的直射光和較低的空氣濕度，也有助于蹲蕾。一般15℃的溫度持續7天即可達到蹲蕾的目的。