二是幼體的餌料營養不良。在蝦蟹育苗過程中，較多地使用人工餌料，常常造成幼體消化吸收不良，營養不全，使幼體體質下降，對病原菌的抵抗力減弱，而容易患病。中草藥對部分營養失調的餌料可起到一定的平衡作用，防止疾病發生。此外，有些中草藥還具有明顯的誘食性。

三是有害微生物。雖然在魚蝦類育苗過程中對育苗用水進行了選擇、沉淀、砂濾、消毒處理，但細菌、真菌、病毒等有害微生物不可能完全被殺滅，隨著育苗的進行，它們會滋生、發展、侵害幼體。

一種中草藥往往含有多種化學成分，但不是所有的成分都能起到防治疾病的作用，能防治疾病的有效成分主要包括多糖、生物堿、甙類、揮發油、鞣質等。

大蒜：具有廣譜抗菌作用，對病毒和原蟲等都有殺滅作用，屬高效抗菌殺蟲中草藥。在用作殺菌劑時，應新鮮制備，立即使用。

黃連：其有效成分為小檗堿（即黃連素）。黃連具有廣譜抗菌作用，能抑制多種革蘭氏陽性和陰性細菌的生長，對多種真菌有抑制作用，對一些病毒、原蟲等也有效。另外，小檗堿還具有增強動物吞噬細胞吞噬能力的作用。

黃芩：黃芩甙元是其主要有效成分。黃芩具有較廣的抗菌譜，對革蘭氏陰性和陽性球菌均有抑制作用，對一些病毒和多種真菌也有一定效果。

大黃：含有大黃素、大黃酸、蘆薈大黃素等葸醌類衍生物，具有抗菌、抗真菌、抗病毒的作用，對屈橈桿菌有明顯的抑制作用。此外，還具有收斂、瀉下、增加血小板、促進血液凝固的作用。 五倍子：含有鞣質等成分，對革蘭氏陽性和陰性均有抑制作用，對真菌（水霉病）具有良好的防治效果，還具有止血、解毒、收斂等作用。

大青葉和板藍根：其有效成分為大青素、靛甙等。二者均有廣抗菌和抗病毒作用及清熱解毒作用。其中板藍根的抗病毒作用較強。