甲硝唑為抗阿米巴和滴蟲的藥物，對各種厭氧菌感染也有良好的治療效果，且不易形成耐藥菌株、菌群失調和二重感染，與常用抗生素合用無拮抗作用。經臨床實踐證明，該藥對治療雞生殖系統疾病及一些傳染病引起的生殖系統炎癥效果好。

治療蛋雞腹膜炎 應用阿莫西林加甲硝唑聯合治療，即在雞飲水時，按每100公斤純水加入10克阿莫西林，同時在每公斤飼料中加入甲硝哇0.8克，連續使用4~5天。用藥后第四天產蛋率回升，不再出現臥地不起、拉蛋黃樣糞便的雞，用至第五天產蛋率達到80%，再鞏固用藥3天，雞完全恢復產蛋。

治療蛋雞弧菌性肝炎 在每公斤飼料中拌入甲硝唑0.8克，連續飼喂7天，停2~3天，再喂7天，治療效果良好。

治療蛋雞滴蟲病 在每公斤飼料中拌入甲硝唑0.88克，連續飼喂5~6天，10天后雞可痊愈。