心肌炎的癥狀可能出現于原發病的癥狀期或恢復期。如在原發病的癥狀期出現，其表現可被原發病掩蓋。多數病鴨在發病前有發熱、腹瀉等癥狀，反映全身性病毒感染。各種病毒都可引起心肌炎，其中以引起腸道和上呼吸道感染的病毒感染最多。其致病病原體可為細菌、病毒、霉菌、立克次體、螺旋體或寄生蟲。 

傷寒時心肌炎不少見；細菌感染時心肌受細菌毒素的損害。細菌性心內膜炎或心肌炎可以延及心肌，伴發心肌炎，致病菌以葡萄球菌、鏈球菌或肺炎球菌為主，腦膜炎球菌菌血癥、膿毒血癥等可侵犯心肌而引起炎癥，多種霉菌如放線菌、白色念珠菌、曲霉菌、組織胞漿菌、隱球菌等都可引起心肌炎癥。

過敏或變態反應所致的心肌炎，風濕性心肌炎屬于此類。化學、物理或藥物所致的心肌炎 化學品或藥物，或電解質平衡失調如缺鉀或鉀過多時，均可造成心肌損害，病理上有炎性變化；心臟區過度放射，也可引起類似的炎性變化。