小麥種子粒皮薄，無外殼保護，組織松軟，吸水能力強，易滋生病蟲、發熱霉變或發芽。因此，在貯存小麥種子的時候應把好以下六關。

    一、把好純度關。小麥良種要單收、單打、單曬、單獨貯存。貯存時應標上品種名稱，防止與其他品種和普通麥子混淆；要一個容器盛放一個品種，不能一個容器盛幾個品種，更不能與普通麥子同存一處；晾曬時要單場單曬，不要與其他品種和普通麥子同曬一場，以防混雜。

    二、把好水分關。麥種水分含量過大，易發熱，會導致霉變，直接影響種子的發芽率和活力。貯藏前要反復晾曬，使麥種含水量達到安全貯藏水分，小麥安全貯藏水分為13%以下。

    三、把好溫度關。溫度是影響種子新陳代謝的主要因素，貯存的麥種不宜暴曬過度。切忌在水泥地面上曬種，因水泥地面溫度太高，易將種子燒壞；貯存麥種的倉庫溫度最好保持在20℃以下。

    四、把好濕度關。麥種貯藏期間，正值多雨、高溫、高濕季節。高溫高濕能增強種子的呼吸作用，微生物極易在糧堆內繁殖，引起麥種發熱霉變，以致喪失種用能力。因此，麥種應存放在干燥通風處，盛麥種的容器底部要用木板、石塊等防潮物鋪墊。在貯存過程中應經常晾曬，適時通風換氣。

    五、把好存放關。麥種不能存放在廚房里，以免煙火熏烤后，導致種子泛色，水分減少，甚至發熱，影響種子發芽率；不能用塑料袋子貯藏，塑料袋子不透氣，妨礙種子呼吸，會降低發芽率，同時多余的水分散發不出去，容易引起種子霉變；不要與碳銨、尿素等氨態氮肥混存在一室，由于這期間溫度高，濕度大，這些氨態氮肥揮發性極強，揮發的氨氣會腐蝕種子細胞和種胚，嚴重影響發芽率和種子活力。

    六、把好防鼠防蟲關。農戶貯存麥種數量不大，選用水泥缸、瓷缸貯藏，可起到防鼠防蟲的作用。麥種晾曬后趁熱貯藏，可減少蟲害。防治老鼠、害蟲，采用藥劑防治，其特效藥是民用磷化鋁，可防治玉米象(油子)、鋸谷盜等糧食害蟲，每200公斤麥種用藥一片，用布包好放入種子內33厘米左右，密封7天即可殺死害蟲。