洋蔥常見病害有霜霉病、紫斑病、灰霉病和炭疽病等。
防治方法：應采用“預防為主，綜合防治”的植保方針，在農業綜合防治的基礎上，進行無公害化防治。
1、選用抗病品種，實行輪作，增施有機肥、磷鉀肥和微肥，深翻曬垡40天以上，改良土壤，盡力消滅和減少土壤中殘留病菌，減少侵染原。
2、加強肥水管理，特別要注意適時噴灑“天達—2116”，提高植株的抗病性能和適應能力。
3、科學用藥：霜霉病，在發病初期用80%乙磷鋁500倍液+64%殺毒礬500倍液、或70%甲霜靈錳鋅或乙磷鋁錳鋅500倍液、或72%杜邦克露600－800倍液、或72.2%普力克700倍液、或綠乳銅800倍液、或特立克800倍液、或克霜氰600倍液、或75%百菌清800倍液等。
紫斑病，在發病初期用78%科博可濕性粉劑500倍液、或41.5%撲霉靈1500倍液、或75%百菌清可濕性粉劑600倍液、或64%殺毒礬可濕性粉劑500倍液、或50%異菌脲（撲海內）可濕性粉劑1000倍液等。 灰霉病，發病初期，用25%咪鮮胺乳油1000倍液、或施佳樂懸浮劑1200倍液、或速克靈3000倍液、或50%撲每因可濕性粉劑1500倍液等。 炭疽病，在發病初期用10%世高水分散顆粒劑1500--2000倍液、或用25%咪鮮胺（使百克）乳油1000倍液、或50%炭疽福美可濕性粉劑500-800倍液。
以上各防病藥液均需摻加800倍中性肥皂粉并間隔摻加600倍“天達—2116”交替噴灑，每7—10天1次，連續噴灑2—3次。均可取得良好防治效果。