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腸桿菌科有一些共同特性，比如都是革蘭氏陰性小桿菌，好氧或兼性厭氧，沒有芽孢。
| 屬 | 代表種 | 致病性 |
| 埃希氏菌屬
（Escherichia） |
大腸埃希氏菌
(E.coli) |
腸道外感染，
急性腹瀉 |
| 志賀氏菌屬
（Shigella） |
痢疾志賀氏菌
(Sh.dysenteriae) |
細菌性痢疾 |
| 愛德華氏菌屬
（Edwardsiella） |
遲純愛德華氏菌
(E.tarda) |
蛇類等血動物的正常腸道寄居菌，偶見于健康人或腹瀉者糞便內 |
| 沙門氏菌屬
（Salmonella） |
傷寒沙門氏菌
(S.typhi) |
腸熱癥、急性腸炎、敗血癥 |
| 枸櫞酸桿菌屬
(Citrobacter) |
弗勞地氏枸櫞酸桿菌
(C.freundii) |
條件致病菌，引起繼發性感染 |
| 克雷伯氏菌屬
(Klebsiella) |
肺炎克雷伯氏菌
(K.pneumoniae) |
肺炎，泌尿系、創傷感染
敗血癥等 |
| 腸桿菌屬
(Enterobacter) |
產氣桿菌
(E.aerogenes) |
很少引起原發性感染 |
| 哈夫尼亞菌屬
(Hafnia) |
蜂窩啥夫尼亞菌
(H.alvei) |
對人無致病性 |
| 沙雷氏菌屬
(Serrati) |
粘質沙雷氏菌
(S.marcescens) |
條件致病菌，引起泌尿系，
呼吸道及創傷感染 |
| 變形桿菌屬
(Proteus) |
普通變形桿菌
(P.vulgaris) |
食物中毒，泌尿系、呼吸道感染
等 |
| 耶爾森氏菌屬
(Yersinia) |
鼠疫耶爾森氏菌
(Y.pestis) |
鼠疫 |
| 歐文氏菌屬
(Erwinia) |
草原居民歐文氏菌
(E.herbicola) |
植物寄生菌，曾從人體腸道及化膿扁桃體中分離到 |
